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2013年 08月 04日
今日は朝(昼前)にスタバで軽く食べてラボに向かった。もうコーヒーはやめたからタゾティーにしてる。
昨日のサイトメトリーのデータ解析。こういうのって、ゲートのとりようでデータが変わってしまうことが結構こわい。もちろんisoコントロールをとるけど、isoは所詮iso。もちろん培養細胞にGFP導入とかは簡単だけど、エンドのCDマーカーは結構ややこしいのがある。biologicalなseparationをどこまで反映して線を引くかってあまりコンセンサスがない気がする。免染もそうだけど、ノックアウトサンプルが理想的なコントロールだろう。しかしルーチンで使うCDマーカーをわざわざ全種類ノックアウト集めて毎回確認って、神業すぎる。ラボじゃなくて工場でしかできない。 特にマニアックな細胞ほど過去の論文を参考に線を引いても、元の論文が合ってるとは限らない。また、サイトメトリーマシンの設定でかなりデータの見た目が変わる。そして変にセンシティブで、ラボ間のデータにばらつきが出てもおかしくない。昨日はそういう例をまたひとつ体験した。 毎日やるからこそ実感するけど、サイトメトリーのデータには絶対定量性などない。 やはりあくまでもサイトメトリーは傍証に過ぎない。見てる細胞の機能を見て正体をつかむ必要がある。 解析の合間にスカイプ会議。大学院生コミュニティのこと。座談会は面白ろそうだ。まずはこのパソコン音痴をどうにかしないと。 これからプラナリアの友人宅で鍋をしに行く。真夏だけど鍋。hot panを更にhotにしてくれるらしい。
by sugirioblog
| 2013-08-04 08:12
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